Ткань мозга изолирована не только от растворенных веществ, но и от клеток, циркулирующих в крови, в первую очередь, от иммунных клеток. Ограничение входа иммунных клеток в мозговую ткань — это нейропротекторный механизм, защищающий нейроны от нежелательной воспалительной реакции, которая может вызывать их гибель. Другие клетки, вход которых крайне вреден для ЦНС — это патогены (бактерии, грибы, простейшие) и циркулирующие опухолевые клетки, которые могут дать начало метастазам.